Accélérer le diagnostic génétique des patients
En France, Axians a contribué à la mise en œuvre de DIAGHO, un portail d'interprétation de données de séquençage génétique. Un projet porté par les CHU de Rennes et de Nantes.
Les avancées majeures de la génomique ouvrent de nouvelles perspectives pour les patients atteints de cancers ou de maladies rares. En permettant de lire et d’analyser l’ensemble du génome d’un individu, le séquençage génétique contribue à une médecine plus personnalisée et à la mise en œuvre de traitements adaptés au profil de chaque patient.
Parmi les pays pionniers dans l’intégration clinique du séquençage à l’échelle nationale, la France mise sur le partage des connaissances et la coopération entre établissements de santé pour relever les défis scientifiques et médicaux encore liés à l’interprétation des données génétiques.
Cette démarche collaborative a conduit au développement de DIAGHO, une plateforme d’aide au diagnostic des maladies rares fondée sur les technologies de séquençage à haut débit, ou Next-Generation Sequencing (NGS). Ces technologies permettent d’identifier, de filtrer et d’analyser de nombreuses variations génétiques présentes dans l’ADN ou l’ARN des patients.
Le projet a été décidé en 2019 dans le cadre du groupement de coopération sanitaire des Hôpitaux Universitaires du Grand Ouest (GCS HUGO), qui fédère les six centres hospitaliers des régions Bretagne, Pays de la Loire, Centre-Val de Loire, ainsi que l’Institut de cancérologie de l’Ouest et deux centres hospitaliers du Mans et de Vendée.
Pour le groupement, l’un des enjeux consistait à faire de DIAGHO un objet souverain, à placer le contrôle des données médicales sous gouvernance publique en écartant tout hébergement auprès d’un cloud externe.
Deux hôpitaux universitaires ont porté le projet : le CHU de Rennes, qui a développé la plateforme, et le CHU de Nantes, chargé de la mettre en place techniquement avec l’aide d’Axians, déjà partenaire de longue date.
Pour fonctionner sur les ordinateurs de tous les hôpitaux concernés, quels que soient leurs équipements, DIAGHO repose sur une technique appelée « conteneurisation ». Christophe Fogel, Senior Business développeur Santé chez Axians, explique : « La conteneurisation consiste à regrouper le code logiciel, uniquement avec les bibliothèques du système d’exploitation et les dépendances nécessaires, pour les isoler dans un seul exécutable léger, appelé conteneur, qui opère de manière cohérente sur n’importe quelle infrastructure. Les développeurs peuvent ainsi créer et déployer des applications plus rapidement et en toute sécurité dans tous les environnements, quel que soit le système d’exploitation. »
Le savoir-faire technique a été transmis aux équipes des CHU de Rennes et de Nantes, qui gagnent ainsi en autonomie pour l’évolution de la plateforme.